和传统绿化相比，屋顶绿化与大地隔离，屋顶绿化工程所种植的植物所需水分完全依靠自然降水和人工浇灌，又由于建筑环境的局限，屋顶绿化工程种植土层的厚度不大，而且植物的生长环境较恶劣。所以屋顶绿化工程施工过程中的植物选择难度较大，选择植物时既需注意植物生长所需的土层厚度，满足生长要求，又需要考虑到植物配置技术，所以，屋顶绿化工程植物种植的选择必须考虑以下几点：
1.光照
屋顶接受到的太阳辐射较多，紫外线强度较大，因此应选择喜阳植物或沙生类植物，如景天类，而封闭式屋顶(四周高，中间低)绿化被包围于众多建筑物之中，受阳光辐射较少甚至无阳光照射，这种情况下的屋顶绿化工程应选择喜阴植物。
2.温度
一般情况下的屋顶位置较高，日照辐射强，楼板等屋面材料升温较快，降温也快，屋顶昼夜温差较大，有利于植物有机物质积累，所以对植物冻害侵害较小。
3.湿度
由于地势高，日照充足，温度高，风大及屋顶种植层土层有限，所以水分蒸发较快，种植层湿度相对较低，所以，屋顶水分因素对植物选择有较高要求。
4.风力及土壤
由于屋顶的遮挡物较少，所以应尽量选择低矮、抗风力强的植物；屋顶绿化工程的种植土一般由人工合成的轻型基质，土层较薄，因此对于植物养分及水分的吸收有一定限制。
因此，在屋顶绿化工程植物种植的选择上应多以低矮的灌木和草本植物为主，配合低矮灌木、草坪、地被和攀缘植物，选择时应根据当地气候情况，选择抗旱、抗寒、耐高温、抗强风、耐瘠薄等抗逆性较强的乡土植物且尽量做到选择常绿且冬季可以露地越冬的植物进行栽植；应以小乔木、低灌木、草坪、地被和攀缘为主，来降低屋顶承受能力和防水费用；选择移植易成活，耐修剪、生长缓慢的植物及养护管理要求较低，费用较低的植物；选择可以吸收污染的环保植物。
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